SECONDA SERIE

2.01 - See No Evil
La moglie e la figlia di nove anni di un capitano della Marina vengono rapite, e il capitano diviene ostaggio nel suo stesso ufficio, nel quale, attraverso una web cam, può vedere e comunicare con i rapitori. Il team dell'Ncis indaga sul crimine in cui è coinvolta una grossa somma di denaro.

2.02 - The Good Wives Club
I resti mummificati di una donna vengono ritrovati in un residuo abbandonato.Il team dell’Ncis scopre che la donna era scomparsa da diversi mesi, che indossava un abito da sposa al momento della morte e che probabilmente è vittima di un serial killer. Le ricerche riguardo all’omicidio conducono il team fino in Florida, dove iniziano le indagini su un’altra donna misteriosamente scomparsa al ritorno dal lavoro.Uno degli indizi che Gibbs e soci hanno è l’antico manuale per le buone mogli.

2.03 - Vanished
Un elicottero della Marina viene scoperto nel mezzo del cerchio di un raccolto in un’area rurale, ma dei piloti non c’è alcuna traccia.

2.04 - Lt. Jane Doe
Il corpo di una donna in uniforme della Marina viene trovato da due marinai. Duckie ricollega l’omicidio ad un caso irrisolto risalente a dieci anni prima. Il team si mette subito al lavoro per risolvere il mistero.

2.05 - The Bone Yard
L’ NCIS scopre che un’area del territorio di fuoco della Marina è il luogo in cui la Mafia ha gettato dei corpi.Una delle vittime è un agente del Fbi. L’ Agente Fornell viene accusato di essere complice dell’organizzazione criminale.

2.06 - Terminal Leave
Un ex veterano della guerra in Iraq viene minacciato da dei terroristi. Il team di Gibbs viene chiamato per proteggerlo.

2.07 - Call of Silence
Ernie Yost, un veterano della Marina che si è guadagnato una medaglia all'onore, chiede aiuto al team dell'NCIS; sessant'anni prima l'uomo ha infatti commesso un omicidio ma non ricorda più come sia successo... Gibbs cerca il tutto e per tutto per scagionare Ernie ed evitare che vada in prigione.

2.08 - Heart Break
Il comandante Dornam, dopo un'operazione a cuore muore, muore per una combustione interna. Ben presto si scopre che la morte non è affatto accidentale: qualcuno deve aver immesso dell'ossigeno nel suo addome. Gibbs e il suo team vengono chiamati ad indagare.

2.09 - Forced Entry
Laura Rowen, moglie di un marine, spara ad un uomo per difendersi da un tentativo di violenza carnale. Il team di Gibbs indaga e scopre che la donna in realtà ha sempre condotto una doppia vita mentre il marito era all'estero per lavoro...

2.10 - Chained
Tony scompare misteriosamente durante un'operazione sotto copertura. Il localizzatore GPS impiantatogli da Abby smette di funzionare e il team di Gibbs è costretto ad intervenire prima che Tony venga ucciso.

2.11 - Blackwater
Il corpo di un ufficiale della Marina scomparso da due anni viene misteriosamente ritrovato in una macchina recuperata in un lago. Uno strano investigatore privato reclama la taglia che la famiglia della vittima ha offerto per il suo ritrovamento. Peccato che l'NCIS scopre che nel corpo della vittima vi è una pallottola...

2.12 - Doppelgänger
Un agente viene ritrovato morto mentre si trovava al telefono. Gibbs viene chiamato come sempre ad indagare e ben presto scopre che la telefonata che l'uomo stava facendo prima di morire era in realtà uno scherzo.

2.13 - Meat Puzzle
Dopo un'attenta ricostruzione dei pezzi di alcuni corpi umani ritrovati, Ducky identifica tre cadaveri: uno di un poliziotto e uno di un giudice. Entrambe le vittime avevano lavorato con Ducky in un caso di stupro avvenuto dieci anni prima. Gibbs inizia a credere che l'amico e collega Ducky potrebbe essere la prossima vittima e ordina al suo team di proteggerlo.

2.14 - Witness
Una donna confessa di aver visto qualcuno uccidere un marine nell'appartamento vicino al suo. Gibbs assegna il caso a Tim il quale crede di poter risolvere il tutto da solo.

2.15 - Caught on Tape
Un marine in gita al Parco Nazionale viene ritrovato cadavere in fondo ad uno strapiombo. Gibbs ed i suoi uomini vengono chiamati ad indagare ed iniziano con l'analisi della cassetta che pare aver videoregistrato la caduta dell'uomo.

2.16 - Pop Life
Willie Taylor si risveglia al fianco di una donna cadavere. la vittima è Manda King, sottufficiale della Marina. Al team dell'NCIS l'uomo confessa di essersi addormentato la sera prima al fianco di un'altra donna.

2.17 - An Eye for An Eye
Un marine riceve per posta una busta contenente due occhi azzurri. Il team dell'NCIS scopre ben presto che quegli occhi appartenevano alla moglie di un agente dei servizi segreti.

2.18 - Bikini Wax
Durante un concorso di bellezza estivo, una delle cocnorrenti viene ritrovata misteriosamente cadavere. La vittima era in realtà un sottoufficiale di marina appena rientrata dopo un imbarco di due mesi. Il team di Gibbs viene chiamato ad indagare.

2.19 - Consipacy Theory
Il team dell'NCIS indaga su un presunto caso d'omicidio. L'unico a credere che la ragione della morte della vittima non è il suicidio è Ducky. L'agente speciale dell'FBI Fornell aiuta il team nelle indagini e ben presto viene scoperto che la donna era invischiata in un triangolo amoroso.

2.20 - Red Cell
Un marine viene ritrovato morto in un campus. Tim e Abby, che indagano insieme al team di Gibbs, scoprono delle tracce di e-mails chiamate "Red Cell" che li porta a credere che il Marine fosse invischiato in un gioco mortale.

2.21 - Hometown Hero
Un giovane Marine viene ucciso in Iraq e parallelamente viene scoperto il corpo di una giovane donna che la vittima conosceva. Le autorità credono immediatamente che il Marine sia il colpevole, ma Gibbs cerca di scagionarlo e provare, al contrario, la sua innocenza.

2.22 - SWAK
Tony apre una misteriosa lettera che pensa sia diretta a lui ed improvvisamente una polvere bianca fuoriesce dalla busta. Il team pensa subito a un virus letale e, per precauzione, Kate e Tony vengono isolati in una stanza. Mentre McGee e Gibbs cercano di scoprire il mittente della busta, la salute di Tony inizia a peggiorare.

2.23 - Twilight
Un gruppo di terroristi cercano vendetta e mandano Ari (guest star Rudolf Martin) ad uccidere Gibbs. Il team dell'NCIS cerca di proteggere l'uomo ma Ari ha un secondo piano. Oramai è troppo tardi e un membro del team muore...